這是由於Label free 的定量原理決定的，Label－free為非同位素標記技術，樣品內沒有同位素標簽，每個樣本單獨酶解後，依次獨立進行色譜分離和質譜分析，後續通過比較不同樣本中相應肽段的信號強度，來對肽段對應的蛋白質進行相對定量，所以無論任何樣本類型，隻要是同一蛋白或基因，都可以比較。